Cet ouvrage en deux volumes dirigé par Pierre Pétrequin, Estelle Gauthier et Anne-Marie Pétrequin et regroupant 59 auteurs de treize nationalités européennes retrace la circulation des grandes haches polies et des anneaux-disques néolithiques en jades alpins à travers l'Europe du VIe au IIIe millénairs av. J.-C. 
Le 14 janvier 2017, la MSHE Ledoux accueillait dans ses nouveaux locaux place Saint Jacques la première manifestation scientifique. Organisé par Maxime Kaci, chercheur au laboratoire des Sciences Historiques, le forum citoyen « Frontière du passé, frontière dépassées ? » s'est tenu dans la salle de conférence. Centré sur les questions de frontières et politiques territoriales entre Bourgogne, Franche-Comté et Suisse, le forum s'est inscrit dans le prolongement de travaux menés à la MSHE Ledoux par Maxime Kaci depuis 2014.
La conférence « INTI2016 », qui s'est tenue les 23, 24 et 25 novembre 2016 à Charleroi et Liège en Belgique, a été la XVe conférence annuelle internationale du International Network of Territorial Intelligence (INTI). Elle était consacrée au thème « l'économie sociale et solidaire dans les territoires ».
Le 8e colloque international de l'Association française pour l'archéologie du verre (AFAV) s'est tenu à Besançon du 5 au 7 décembre 2016. A l'initiative d'Inès Pactat, doctorante en archéologie à la MSHE Ledoux (1) et de Claudine Munier, archéologue au service d'archéologie préventive de Besançon et présidente de l'AFAV, le colloque était co-organisé par la MSHE Ledoux, l'AFAV, la direction du patrimoine historique de la ville de Besançon et le laboratoire Chrono-Environnement (2). Plus d'une centaine de participants se sont retrouvés au Kursaal, chercheurs, étudiants mais aussi verriers, restaurateurs et passionnés, pour échanger autour du verre médiéval en Europe Occidentale. Les intervenants, venus de dix pays européens, ont dressé un état des lieux des avancées récentes de l'histoire et de l'archéologie du verre, qu'il s'agisse de vaisselle, de vitraux, de perles et parures.
Mohammed Zakaria Ali-Bencherif et Azzeddine Mahieddine (1) étaient invités le 30 novembre 2016 pour une conférence organisée par Anne-Sophie Calinon et Nathalie Thamin (2) dans le cadre de l'action « Dynamiques spatiales, langagières, identitaires de la circulation migratoire étudiante (Maghreb, France et Canada) (3) » de la MSHE Ledoux. La conférence a porté sur les utilisations de l'arabe algérien sur supports numériques et les évolutions de la langue induites par ces usages.
La publication en octobre 2016 du livre De l'humeur normale à la dépression en psychologie cognitive, neurosciences et psychiatrie (1), coordonné par Éric Laurent (2) et Pierre Vandel (3), est l'occasion de revenir sur les travaux menés par Éric Laurent à la MSHE Ledoux depuis 2009. Éric Laurent est responsable scientifique de deux actions de recherche complémentaires inscrites dans le pôle « Comportements, risques, santé » de la MSHE.
La fin de vie en prison soulève des questions médicale, juridique et éthique, qui se posent avec d'autant plus d'acuité que la population carcérale tend à vieillir. La recherche PARME, menée à la MSHE Ledoux par Aline Chassagne (1) doctorante en socio-anthropologie et Aurélie Godard-Marceau (2) socio-démographe, s'est intéressée la situation des personnes détenues malades relevant de soins palliatifs. Conduite de 2011 à 2014, avec le soutien financier de la Fondation de France et coordonnée par Régis Aubry (CHRU de Besançon), la recherche PARME est inédite en France.
Organisée par Nathalie Joly (Agrosup Dijon), Laurent Heyberger (UTBM) et Fabien Knittnel (UFC), cette journée s'est tenue le 3 novembre 2016 à la MSHE Ledoux. Le projet FEMSCITE (1) porté par les trois chercheurs a été lauréat au printemps 2016, avec cinq autres propositions, de l'appel à projets commun lancé par la MSHE Ledoux et la MSH de Dijon dans le cadre de la mise en place d'un axe transversal « Transmission, travail, pouvoirs » par la Fédération des Maisons des Sciences de l'Homme de Bourgogne et de Franche-Comté. La journée d'étude s'est centrée sur la place des femmes dans les structures régionales d'enseignements techniques et scientifiques du XIXe au XXIe siècles.
De l'humeur normale à la dépression en psychologie cognitive, neurosciences et psychiatrie vient de paraître aux éditions De Boeck Supérieur. L'ouvrage est coordonné par Eric Laurent, responsable des actions « Oculomotricité, cognition et processus thymiques » (OCT) et « Marqueurs oculomoteurs précoces de la maladie d'Alzeimer et de la dépression » au sein de la MSHE et par Pierre Vandel Professeur de psychiatrie à l'université de Franche-Comté.
La MSHE C. N. Ledoux était présente à la Fête de la science, sur le campus de la Bouloie, du 13 au 16 octobre 2016, avec un stand tourné vers les technologies innovantes de réalité augmentée et de réalité virtuelle. Les jeudi et vendredi étaient réservés aux scolaires et le week-end ouvert à tout public. Pendant quatre jours, plusieurs centaines de visiteurs sont venus découvrir des aspects du travail de chercheur en sciences humaines et sociales à travers deux animations scientifiques.
La sortie du film de Xavier Dolan Juste la fin du monde, Grand Prix du Jury du festival de Cannes 2016, était l'occasion de présenter les ressources que représentent les archives de Jean-Luc Lagarce numérisées et mises en ligne dans le cadre de l'action FANUM-FC (fonds d'archives numériques de Franche-Comté) de la MSHE Ledoux. La journée d'étude, organisée par Pascal Lécroart, responsable de FANUM-FC et Alexis Leprince, doctorant de la MSHE, s'est déroulée le 7 octobre 2016 au Centre Dramatique National de Besançon devant un large public.
Cet ouvrage écrit par Bruno Prat (directeur de la stratégie et du développement commercial du groupe LFA et chercheur associé au laboratoire des Sciences historiques de l'université de Franche-Comté) retrace l’histoire de La Fonte Ardennaise, petite fonderie artisanale fondée en 1926 devenue une entreprise d’envergure européenne au début du XXIe siècle, et met en perspective les singularités de la croissance d’une PME familiale. 
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